MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar thuringiensis str. IS5056 plasmid pIS56-39

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020381	ATG	2	6	5	10	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_020381	AAG	2	6	11	16	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020381	GTA	2	6	51	56	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020381	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_020381	GAT	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020381	CAT	3	9	277	285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_020381	GATT	2	8	423	430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_020381	GAA	2	6	523	528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_020381	CTT	2	6	547	552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_020381	T	6	6	627	632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020381	TA	3	6	677	682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020381	TCA	2	6	741	746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_020381	ATC	2	6	761	766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020381	ATG	2	6	776	781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020381	ATA	2	6	851	856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020381	TCA	3	9	876	884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020381	ATTCA	2	10	959	968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_020381	TCG	2	6	1009	1014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020381	TAA	2	6	1034	1039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020381	GTT	2	6	1117	1122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020381	CTT	2	6	1126	1131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_020381	TAA	2	6	1231	1236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020381	TCT	2	6	1246	1251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_020381	T	6	6	1259	1264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020381	TGCT	2	8	1271	1278	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_020381	T	6	6	1295	1300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020381	TTTG	2	8	1305	1312	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020381	TCA	2	6	1318	1323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020381	T	6	6	1516	1521	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020381	GTA	2	6	1675	1680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020381	TTG	2	6	1703	1708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020381	CATA	2	8	1738	1745	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_020381	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020381	TAT	2	6	1807	1812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020381	TTG	2	6	1826	1831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020381	TAA	2	6	1844	1849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020381	AGA	2	6	1865	1870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020381	TTC	2	6	1952	1957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_020381	CCAG	2	8	2030	2037	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_020381	TCC	2	6	3101	3106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_020381	TATT	2	8	3136	3143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020381	ATTTAT	2	12	3176	3187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020381	ACA	2	6	3201	3206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020381	ATT	2	6	5615	5620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020381	TTA	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020381	TAAC	2	8	5638	5645	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_020381	AAAC	2	8	5672	5679	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_020381	AGT	2	6	5731	5736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020381	TAT	2	6	5775	5780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020381	TTAG	2	8	5785	5792	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020381	TAAC	2	8	5806	5813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_020381	GGGA	2	8	6300	6307	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020381	TCC	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_020381	A	7	7	6799	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020381	ACAT	2	8	6808	6815	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020381	A	6	6	7038	7043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020381	AATATA	2	12	7077	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020381	AATT	2	8	7093	7100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020381	CTA	2	6	7124	7129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_020381	AG	3	6	7137	7142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020381	TAAG	2	8	7752	7759	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_020381	ATT	2	6	7828	7833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020381	GAA	2	6	7857	7862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020381	TCTTT	2	10	7880	7889	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_020381	T	6	6	7887	7892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020381	ATT	2	6	7896	7901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020381	TATGA	2	10	7905	7914	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020381	ATAAA	2	10	7942	7951	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020381	AGA	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020381	GGT	2	6	7995	8000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020381	TC	3	6	8190	8195	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_020381	CA	3	6	8257	8262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_020381	T	6	6	8459	8464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020381	TAAAAA	2	12	8473	8484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020381	A	7	7	8480	8486	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020381	GCC	2	6	8521	8526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_020381	TAC	2	6	8527	8532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020381	A	7	7	8606	8612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020381	T	6	6	8646	8651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020381	A	6	6	8661	8666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020381	GGA	2	6	8669	8674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020381	T	7	7	8675	8681	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020381	TAG	2	6	11266	11271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_020381	AACT	2	8	11293	11300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_020381	GAG	2	6	11561	11566	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020381	ACC	2	6	11598	11603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_020381	AAAT	2	8	11607	11614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020381	T	6	6	11634	11639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020381	CTC	2	6	11701	11706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_020381	AG	3	6	12140	12145	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020381	TA	3	6	12154	12159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020381	AGG	2	6	12180	12185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020381	A	6	6	12570	12575	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020381	ATTTA	2	10	12590	12599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020381	ATA	2	6	12648	12653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020381	TAT	2	6	12670	12675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020381	GAA	2	6	12694	12699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020381	CATT	2	8	12706	12713	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_020381	TCTTT	2	10	12723	12732	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_020381	GAT	2	6	12744	12749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020381	TA	3	6	12756	12761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020381	TAT	2	6	12771	12776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020381	A	7	7	12799	12805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020381	T	7	7	12878	12884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020381	AT	4	8	12897	12904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020381	TATAA	2	10	12907	12916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020381	TTA	2	6	12936	12941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020381	GGA	2	6	12956	12961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_020381	AGG	2	6	13000	13005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020381	T	7	7	13640	13646	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020381	GTTT	2	8	13689	13696	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_020381	GTA	2	6	13731	13736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020381	GAG	2	6	13775	13780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020381	GGC	2	6	15174	15179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020381	GAT	2	6	15217	15222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020381	A	7	7	15479	15485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020381	T	6	6	15507	15512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020381	T	7	7	16892	16898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020381	A	7	7	16926	16932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020381	GGAA	2	8	16933	16940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020381	CAA	2	6	16995	17000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_020381	A	7	7	16999	17005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020381	CTC	2	6	17032	17037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_020381	GGTA	2	8	17214	17221	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020381	GATT	2	8	17345	17352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020381	TA	3	6	18023	18028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020381	GA	3	6	18070	18075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020381	CAT	2	6	18387	18392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020381	TTG	2	6	18445	18450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020381	T	6	6	18513	18518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_020381	ATA	2	6	18520	18525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020381	TA	3	6	18524	18529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020381	AG	3	6	18557	18562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020381	CT	3	6	18569	18574	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020381	CCT	2	6	18745	18750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_020381	TTA	2	6	18764	18769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020381	AAAT	2	8	18793	18800	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020381	A	6	6	18817	18822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020381	T	7	7	18827	18833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020381	A	6	6	18847	18852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020381	T	6	6	18879	18884	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_020381	CAAA	2	8	19965	19972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_020381	CCT	2	6	20528	20533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_020381	T	6	6	20551	20556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020381	TAGA	2	8	20616	20623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020381	ACC	2	6	20633	20638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_020381	TAA	2	6	20682	20687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020381	TGA	2	6	20712	20717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_020381	TTC	2	6	20728	20733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_020381	GTA	2	6	20748	20753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020381	TTA	2	6	20758	20763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020381	AGG	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020381	ACA	2	6	20776	20781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_020381	T	7	7	22021	22027	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_020381	T	6	6	22057	22062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020381	ATTT	2	8	22144	22151	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020381	T	6	6	22171	22176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_020381	A	6	6	22229	22234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_020381	CTG	2	6	22237	22242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020381	TCC	2	6	23488	23493	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
161	NC_020381	TC	3	6	25893	25898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
162	NC_020381	A	6	6	32342	32347	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_020381	CCG	2	6	32665	32670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_020381	TA	3	6	32672	32677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_020381	TCAA	2	8	32686	32693	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_020381	A	7	7	38962	38968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_020381	T	6	6	38981	38986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_020381	GT	3	6	39679	39684	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020381	TTC	2	6	39730	39735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.